石文清

姓名:石文清
专业:遗传学
研究领域:植物生殖发育的分子机制研究
联系方式:电话:13691163796;邮箱:swq7.11@163.com
个人简介:
石文清,男,讲师,硕士生导师。细胞生物学博士。从事植物生殖发育的分子机制研究方面的工作。主持博士后面上项目和青年基金项目,作为项目组主要成员参与国家自然科学基金地区联合基金1项和国家自然科学基金面上项目2项;以第一作者身份在New phytologist (五年影响因子10.2,中科院一区)发表3篇SCI论文。此外,以主要参与作者身份在Nature Communications、PNAS、Molecular Plant、Plant Cell、Plant Physiology等国际主流学术期刊发表13篇SCI论文。指导本科毕业生1人。
教育背景:
2017.08-2023.02,博士后,遗传学,中国科学院遗传与发育生物学研究所
2012.09-2017.06,博士,细胞生物学,中国科学院大学
2009.09-2012.06,硕士,遗传学,西北农林科技大学
2005.09-2012.06,学士,生物科学,延安大学
工作经历:
2023.04-至今,讲师,山西师范大学生命科学学院
科研项目:
1. 国家自然科学基金青年项目:水稻减数分裂温度敏感基因TSM1的克隆与功能研究(项目编号:32000368),研究周期为2021年1月-2023年12月,目前项目已结题,担任项目主持人,相关研究成果不仅可深化温度对减数分裂影响机制的了解,同时也为作物遗传育种提供基因资源和理论支撑。
2. 中国博士后科学基金面上项目:同源重组蛋白COF1在水稻减数分裂中的功能研究(项目编号:2018M631612),研究周期为2018年5月-2020年5月,目前项目已结题,担任项目主持人,相关研究成果为水稻生产育种提供了理论基础。
3. 国家自然科学基金面上项目:水稻NRI1基因参与同源重组保障的机制及调控网络研究(项目编号:32272113),研究周期为2023年1月-2026年12月,目前项目在研,本人担任项目骨干参与课题研究,相关研究成果为最终揭示水稻同源重组可能的保障机制及调控网络提供新的线索。
4. 国家自然科学基金地区联合基金项目:野生稻低重组频率基因克隆与早时代稳定材料创制(项目编号:U2102219),研究周期为2022年1月-2025年12月,目前项目在研,本人担任项目骨干参与课题研究,对于提高野生稻资源的有效利用具有十分重要的意义。
5. 国家自然科学基金面上项目:一个水稻减数分裂纺锤体组装相关基因的克隆与功能研究(项目编号:31771363),研究周期为2018年1月-2021年12月,目前项目已结题,本人担任项目骨干参与课题研究,相关研究成果从植物水平上补充完善了已有的纺锤体建成理论。
学术论文:
第一作者文章
1. Zhang FF#, Shi WQ#, Zhou Y#, Ma LJ, Miao YJ, Mu N, Ren HY, Cheng ZK* (2023). RAD51C-RAD51D interplays with MSH5 and regulates crossover maturation in rice meiosis. New Phytologist, 239(5):1790-1803.(该研究成果以共同第一作者发表于New Phytologist (2023, IF=8.3,中科院一区)。该研究工作首次证实RAD51C–RAD51D复合体在重组早期作为RAD51/DMC1招募平台促进单链入侵,晚期与MSH5协同调控重组中间体解旋及 交叉成熟。为利用基因 编辑人工提高重组频率、加速作物遗传聚合提供了可直接操作的基因模块。)
2. Shi WQ, Ji JH, Xue ZH, Zhang FF, Miao YJ, Yang H, Tang D, Du GJ, Li YF, Shen Y, and Cheng ZK (2021). PRD1, a homologous recombination initiation factor, is involved in spindle assembly in rice meiosis. New Phytologist, 230(2):585-600.(该研究成果以第一作者发表于New Phytologist(2021, IF=10.323,中科院一区)。该工作首次证实PRD1通过桥联动粒-微管界面参与纺锤体极性建成,填补了“植物减数分裂无中心体纺锤体如何获得双极性”的理论空白。为作物育性稳定、非整倍体育种风险防控提供了可操作的分子靶点。)
3. Shi WQ#, Tang D#, Shen Y, Xue ZH, Zhang FF, Zhang C, Ren LJ, Liu CZ, Du GJ, Li YF, Yan CJ, and Cheng ZK (2019). OsHOP2 regulates the maturation of crossovers by promoting homologous pairing and synapsis in rice meiosis. New Phytologist, 222(2): 805-819.(该研究成果以第一作者发表于 New Phytologist(2019, IF=8.512,中科院一区)。该工作首次利用超分辨显微成像系统在植物细胞中捕获HOP2纳米级分布,发现其与 联会复合体中央元件ZEP1直接互作,构建“HOP2-ZEP1协同调控同源重组”的新模型。为解析减数分裂同源重组起始的时空精确性提供了可视化证据。)
参与发表文章
1. Yang H# , Li YF# , Cao YW, Shi WQ, Xie E, Mu N, Du GJ, Shen Y, Tang D, Cheng ZK (2022). Nitrogen nutrition contributes to plant fertility by affecting meiosis initiation. Nature Communications,13(1):485. (影响因子15.805,综合性期刊 1 区)
2. Miao YJ, Shi WQ, Wang HJ, Xue ZH, You HL, Zhang FF, Du GJ, Tang D, Li YF, Shen Y, Cheng ZK (2021). Replication protein A large subunit (RPA1a) limits chiasma formation during rice meiosis. Plant Physiology, 187(3):1605-1618. (影响因子8.972,生物 2 区)
3. Zhang FF, Shen Y, Miao CB, Cao YW, Shi WQ, Du GJ, Tang D, Li YF, Luo Q, and Cheng ZK. (2020). OsRAD51D promotes homologous pairing and recombination by preventing nonhomologous interactions in rice meiosis. New Phytologist, 227, 824-839. (影响因子10.476,生物 1 区)
4. Liu CZ, Shen Y, Qin BX, Wen HL, Cheng JW, Mao F, Shi WQ, Tang D, Du GJ, Li YF, Wu YF, and Cheng ZK. (2020). Oryza sativa RNA-dependent RNA polymerase 6 contributes to double-strand break formation in meiosis. Plant Cell, 32, 3273-3289. (影响因子12.061,生物 1 区)
5. Xue ZH, Liu CZ, Shi WQ, Miao YJ, Shen Y, Tang D, Li, YF, You AQ, Xu YY., Chong K, and Cheng ZK (2019). OsMTOPVIB is required for meiotic bipolar spindle assembly. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 116, 15967-15972. (影响因子12.061,综合性期刊 1 区)
6. Xu M, Tang D, Cheng XJ, Zhang JX, Tang YJ, Tao QD, Shi WQ, You AQ, Gu MH, Cheng ZK, and Yu HX. (2019). OsPINOID regulates stigma and ovule initiation through maintenance of the floral meristem by auxin signaling. Plant Physiology, 180, 952-965. (影响因子8.972,生物 2 区)
7. Zhang C, Shen Y, Tang D, Shi WQ, Zhang DM, Du GJ, Zhou YH, Liang GH, Li YF, and Cheng ZK. (2018). The zinc finger protein DCM1 is required for male meiotic cytokinesis by preserving callose in rice. PLoS Genetics, 14, e1007769. (影响因子6.284,生物 2 区)
8. Liu CZ, Xue ZH, Tang D, Shen Y, Shi WQ, Ren LJ, Du GJ, Li YF, and Cheng ZK. (2018). Ornithine delta-aminotransferase is critical for floret development and seed setting through mediating nitrogen reutilization in rice. Plant Journal, 96, 842-854. (影响因子7.666,生物 2 区)
9. Ren LJ, Tang D, Zhao TT, Zhang FF, Liu CZ, Xue ZH, Shi WQ, Du GJ, Shen Y, Li YF, and Cheng ZK. (2018). OsSPL regulates meiotic fate acquisition in rice. New Phytologist, 218, 789-803. (影响因子10.476,生物 1 区)
10. Zhao TT, Ren LJ, Chen XJ, Yu HX, Liu CJ, Shen Y, Shi WQ, Tang D, Du GJ, Li YF, Ma BJ, and Cheng ZK. (2018). The OsRR24/LEPTO1 type-b response regulator is essential for the organization of leptotene chromosomes in rice meiosis. Plant Cell, 30, 3024-3037. (影响因子12.061,生物 1 区)
11. Zhang FF, Tang D, Shen Y, Xue ZH, Shi WQ, Ren LJ, Du GJ, Li YF and Cheng ZK. (2017). The F-Box protein ZYGO1 mediates bouquet formation to promote homologous pairing, synapsis, and recombination in rice meiosis. Plant Cell, 29, 2597-2609. (影响因子12.061,生物 1 区)
12. Xue ZH, Li YF, Zhang L, Shi WQ, Zhang C, Feng MS, Zhang FF, Tang D, Yu HX, Gu MH, and Cheng ZK (2016). OsMTOPVIB promotes meiotic DNA double-strand break formation in rice. Molecular Plant, 9, 1535-1538. (影响因子16.357,生物 1 区)
13. Ji JH, Tang D, Shen Y, Xue ZH, Wang HJ, Shi WQ, Zhang C, Du GJ, Li YF, and Cheng ZK. (2016). P31comet, a member of the synaptonemal complex, participates in meiotic DSB formation in rice. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 113, 10577-10582. (影响因子12.061,综合 性期刊 1 区)
承担教学:
1.本科生课程:遗传学、遗传学实验
获奖:
1. 植物基因组学国家重点实验室2021年度夏季青年学术论坛报告二等奖。
2. 植物基因组学国家重点实验室2020年度冬季青年学术论坛墙报优秀奖。
3. 中国科学院大学2014-2015学年三好学生。
一审:段雅婷
二审:张杰
三审:郭飞


